STAGE Optimisation de l’analyse globale du plasma par protéomique très haut débit

Date de mise à jour de l’offre

Imagine, Institut des maladies génétiques :

Plateforme Protéomique PPN Necker Fondé en 2006, la Plateforme Protéomique PPN-Necker a pour mission de permettre aux équipes universitaires de mener à bien leurs projets de protéomique. La plateforme est ouverte à tous les instituts de recherche (en France comme à l'étranger), aux départements cliniques et au secteur privé. L'objectif principal de la plate-forme est le développement d'approches protéomiques translationnelles innovantes pour l'étude des maladies humaines. Grâce à ses activités de service, de collaboration et de recherche et développement, le PPN offre une technologie et une expertise de pointe pour aider à comprendre les maladies (PTM, protéomique différentielle et d'interaction) et pour rechercher des biomarqueurs de diagnostic/pronostic dans les fluides corporels par SM (protéomique translationnelle et ciblée).

Description de la mission

En 2020, la plateforme protéomique sera équipée d’un nouveau système LC-MSMS à haute sensibilité et haut débit.
Le stagiaire participera à la mise en place d’un protocole standardisé pour l’analyse protéomique des échantillons plasmatiques en vue du passage de cohorte de patients.
Il / Elle suivra la formation proposée par le fournisseur de l’instrument sur le spectromètre de masse et l’analyse des données ; optimisera le protocole existant de préparation du protéome plasmatique et comparera les préparations avec et sans déplétion des protéines majoritaires ; testera différents temps de séparation chromatographiques et les différentes méthodes d'acquisition tels que DIA et DDA et comparera les résultats après l’analyse des données par Maxquant.

Profil recherché

Master 1
Compétences requises :
- Connaissances en biochimie
- Maîtrise de calculs scientifiques (dilutions, concentrations…)
- Sens de l’organisation, rigueur
- Bonnes capacités de synthèse
- Bon niveau d’anglais à l’écrit et à l’oral
- Maîtrise des outils de bureautique

Niveau de qualification requis

Bac + 3
  • Employeur
    Imagine, Institut des maladies génétiques
  • Secteur d’activité de la structure
    Enseignement - Formation - Recherche
  • Effectif de la structure
    De 51 à 250 salariés
  • Type de stage ou contrat
    Stage pour lycéens et étudiants en formation initiale
  • Date prévisionnelle de démarrage
  • Durée du stage ou contrat
    Plus de 4 mois et jusqu'à 6 mois
  • Le stage est-il rémunéré ?
    Oui
  • Niveau de qualification requis

    Bac + 3
  • Lieu du stage
    160 Rue de Vaugirard
    75015 PARIS 15E ARRONDISSEMENT
  • Accès et transports
    Pasteur