STAGE M2 Internship // Searching for disease biomarkers in extracellular vesicles : proof of concept by NMR metabolomic profiling

Date de mise à jour de l’offre

UNIVERSITE PARIS DESCARTES - PARIS 5 :

L’université Paris Descartes dont le nom officiel est Paris-V est une université française créée en 1971. C'est une des treize universités parisiennes5, héritières de l'université de Paris et de la Sorbonne. Elle est pluridisciplinaire et fait partie de la communauté d'universités et établissements (Comue) université Sorbonne-Paris-Cité. Elle se définit comme « l’université des sciences de l'homme et de la santé ». L'université fusionnera au 1er janvier 2019 avec l'université Paris-Diderot et l'Institut de physique du globe pour donner naissance à l'université de Paris. Avec ses 9 Unités de Formation et de Recherche (UFR) et son IUT, l’Université Paris Descartes couvre l’ensemble des connaissances en sciences de l’homme et de la santé. Seule université francilienne réunissant médecine, pharmacie et dentaire, son pôle santé est reconnu en Europe et dans le monde entier pour la qualité de ses formations et l’excellence de sa recherche.

Description de la mission

Extracellular vesicles (EVs), a term that encompasses exosomes, microvesicles and apoptotic bodies, are nanometer sized (40-5000 nm diameter) particles endogenously released by cells in a constitutive or inducible manner. EVs are present in all body fluids and shuttle materials including lipids, proteins, mRNAs and miRNAs, thus constituting a far-reaching intercellular communication pathway modifying their surrounding environment. Formerly regarded as cellular dust, EVs are currently considered to be active players in homeostasis and disease. The amount of EVs is increased in many diseases emphasizing their potential utility as biomarkers in non-invasive liquid biopsies for disease diagnostics, treatment monitoring or pollutant exposure stress. However, specific EV-based signatures reflecting parental cell dysfuntion are still very challenging to identify. Here we aim to explore 1H-NMR metabolomics for profiling EVs from different well defined cell sources and cell priming. The intern will set up protocols to produce EVs with reproducible NMR signatures and analyse changes related to parental cell metabolism (e.g. cancer cells) or parental cell response to environmental stress (e.g. metal exposure).
State-of-the-art NMR sequences will be used to determine the chemical composition of these vesicles and their contents, but also to characterize them in terms of size and stability over time. To that end, the intern will be trained to implement methods that have been developed in the NMR team of substances of biological interest to determine metabolic profiles, to measure molecular mobility, or even to follow the kinetics of the evolution of vesicles during the time. This project will also require the trainee to learn how to implement the main signal processing, structural and dynamic analyses tools, or even the statistical analysis required for the study of such objects.

Profil recherché

A student with a prior good knowledge of bioinformatics and biology will be appreciated.

Niveau de qualification requis

Bac + 4/5 et +
  • Employeur
    UNIVERSITE PARIS DESCARTES - PARIS 5
  • Secteur d’activité de la structure
    Enseignement - Formation - Recherche
  • Effectif de la structure
    Plus de 250 salariés
  • Site internet de la structure
    http://www.parisdescartes.fr
  • Type de stage ou contrat
    Stage pour lycéens et étudiants en formation initiale
  • Date prévisionnelle de démarrage
  • Durée du stage ou contrat
    Plus de 4 mois et jusqu'à 6 mois
  • Le stage est-il rémunéré ?
    Oui
  • Niveau de qualification requis

    Bac + 4/5 et +
  • Lieu du stage
    Université de Paris / Université Paris Descartes Campus Saint-Germain-des-Prés, UMR8601 CNRS
    45 Rue des Saints-pères
    75006 PARIS 6E ARRONDISSEMENT
  • Accès et transports
    Métro Saint-Germain-des-prés