Stage M1 : Application de la RMN à la Santé : analyse métabolomique de fluides biologiques; Application of NMR for Health : metabolomics analysis of biofluids

Date de mise à jour de l’offre

Université Paris Descartes :

L’université Paris-Descartes dont le nom officiel est Paris-V est une université française créée en 1971. C'est une des treize universités parisiennes5, héritières de l'université de Paris et de la Sorbonne. Elle est pluridisciplinaire et fait partie de la communauté d'universités et établissements (Comue) université Sorbonne-Paris-Cité. Elle se définit comme « l’université des sciences de l'homme et de la santé ». L'université fusionnera au 1er janvier 2019 avec l'université Paris-Diderot et l'Institut de physique du globe pour donner naissance à l'université de Paris. Avec ses 9 Unités de Formation et de Recherche (UFR) et son IUT, l’Université Paris Descartes couvre l’ensemble des connaissances en sciences de l’homme et de la santé. Seule université francilienne réunissant médecine, pharmacie et dentaire, son pôle santé est reconnu en Europe et dans le monde entier pour la qualité de ses formations et l’excellence de sa recherche.

Description de la mission

Context: NMR spectroscopy has proved to be a unique tool for probing structure and dynamics in a wide range of molecular assemblies. Continuous methodological developments combined with the breakthroughs which have been accomplished in probe and spectrometer hardwares have led to a variety of high-resolution experiments that have paved the way for an accurate measurement of large ensembles of spin interactions.
We already demonstrated the analytical potential of NMR in metabolomics for the study of human pathologies using biofluids. [1-2]
Objectives: The research proposal aims at finding biomarkers of pathologies in biofluids (urine, blood, ...) using NMR. In collaboration with francilian hospitals and research units of Paris, the student will establish the proof of concept of NMR for the diagnosis of human disease.
Work plan: During this internship, the student will learn how to run an NMR spectrometer, identify metabolites from the spectra and propose biomarkers characterizing the pathology. This metabolomics protocol has been developed and already setup on our platform. He/she will notably evaluate the potential biomarkers to make physiopathological hypothesis. He/she will analyze the resulting spectra in order to evaluate the quality of the data. He/she will be in charge of the analysis of the investigated samples.
[1] Rule-Mining for the Early Prediction of Chronic Kidney Disease Based on Metabolomics and Multi-Source Data. PLOS ONE 2016, 11 (11), e0166905
[2] Urinary metabolic profiling of asymptomatic acute intermittent porphyria using a rule-mining-based algorithm. Metabolomics 2017, 14 (1), 10

Profil recherché

The student should have a License 3 level degree with a background of chemistry or biology or biochemistry and a knowledge of the NMR theory. In addition, some notions of statistical analysis will be appreciated.

Niveau de qualification requis

Bac + 3
  • Employeur
    Université Paris Descartes
  • Secteur d’activité de la structure
    Enseignement - Formation - Recherche
  • Effectif de la structure
    Plus de 250 salariés
  • Site internet de la structure
    http://www.parisdescartes.fr
  • Type de stage ou contrat
    Stage pour lycéens et étudiants en formation initiale
  • Date prévisionnelle de démarrage
  • Durée du stage ou contrat
    Plus de 2 mois et jusqu'à 4 mois
  • Le stage est-il rémunéré ?
    Non
  • Niveau de qualification requis

    Bac + 3
  • Lieu du stage
    UMR8601 CNRS UFR des Sciences Fondamentales et Biomédicales / Campus Saint-Germain-des-Prés
    45 rue des Saints-Pères
    75006 PARIS 6E ARRONDISSEMENT
  • Accès et transports
    Métro Saint-Germain-des-prés