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STAGE Le rôle des ARN régulateurs chez un pathogène humain Clostridium difficile
Date de mise à jour de l’offre
CNRS DR04 ILE DE FRANCE SUD - I2BC :
I2BC - UMR 9198 - Institut de Biologie Intégrative de la Cellule - Laboratoire de recherche - unité mixte de recherche (CNRS, CEA, Université Paris Sud)
Description de la mission
Clostridium difficile est un bacille à Gram positif, anaérobie strict et capable de sporuler. Ce pathogène opportuniste est la principale cause de diarrhées nosocomiales chez les adultes dans les pays industrialisés. Les facteurs de risque sont l’âge et l’antibiothérapie qui par son action sur la flore intestinale facilite l’émergence de C. difficile dans le tube digestif. La proportion de formes sévères d’infections à C. difficile augmente actuellement de manière très préoccupante en Europe. Le pouvoir pathogène de C. difficile résulte de l'action des deux toxines (TcdA et TcdB) qui altèrent le cytosquelette des entérocytes en glucosylant des GTPases régulant le cycle cellulaire. Plusieurs facteurs impliqués dans l’adhésion de C. difficile aux entérocytes ont été identifiés. Cependant, les processus de colonisation du tube digestif et les fonctions associées ainsi que les mécanismes qui contrôlent la virulence sont encore peu étudiés. Des adaptations métaboliques, la motilité, l’efficacité d’adhésion, la capacité de former des biofilms, de sporuler, de germer ou de résister aux stress figurent parmi les processus pouvant jouer un rôle lors du processus infectieux. Mieux comprendre la régulation de ces processus semble indispensable pour l’étude de ce pathogène émergent humain.
Au cours de l’infection, les bactéries reprogramment l'expression de leurs gènes en réponse aux contraintes environnementales. Des études récentes du transcriptome bactérien ont montré la présence d’un grand nombre d’ARN non codants (ARNnc). Ces ARN régulateurs jouent un rôle clé dans la régulation des réponses adaptatives et dans de nombreux processus métaboliques, physiologiques et pathogéniques. Les Clostridies appartiennent à un groupe bactérien ancien qui semble utiliser des mécanismes de régulation complexes basés sur l’action d’ARNnc pour contrôler finement l’expression de leurs gènes, leur permettant ainsi de s’adapter à leurs hôtes et aux conditions environnementales qu’elles rencontrent. Des exemples de tels systèmes de régulation ont été identifiés chez C. perfringens et C. acetobutylicum.
Au cours de l’infection, les bactéries reprogramment l'expression de leurs gènes en réponse aux contraintes environnementales. Des études récentes du transcriptome bactérien ont montré la présence d’un grand nombre d’ARN non codants (ARNnc). Ces ARN régulateurs jouent un rôle clé dans la régulation des réponses adaptatives et dans de nombreux processus métaboliques, physiologiques et pathogéniques. Les Clostridies appartiennent à un groupe bactérien ancien qui semble utiliser des mécanismes de régulation complexes basés sur l’action d’ARNnc pour contrôler finement l’expression de leurs gènes, leur permettant ainsi de s’adapter à leurs hôtes et aux conditions environnementales qu’elles rencontrent. Des exemples de tels systèmes de régulation ont été identifiés chez C. perfringens et C. acetobutylicum.
Profil recherché
L’étudiant participera à l’analyse détaillée des ARNnc identifiés incluant l’identification des cibles et des mécanismes moléculaires mis en jeu dans cette régulation. Cette étude devrait nous permettre de mieux comprendre le rôle de ces nouveaux mécanismes dans le réseau de régulation contrôlant des processus indispensables pour le développement de C. difficile chez l’hôte.
Nous recherchons une personne fortement motivée avec une solide formation en microbiologie, génétique et biologie moléculaire et de l'expérience de recherche. L’intérêt pour l’analyse bioinformatique, les ARNs régulateurs et la pathogenèse, ainsi que les compétences pour le travail d'équipe et communication en anglais sont souhaitables.
Nous recherchons une personne fortement motivée avec une solide formation en microbiologie, génétique et biologie moléculaire et de l'expérience de recherche. L’intérêt pour l’analyse bioinformatique, les ARNs régulateurs et la pathogenèse, ainsi que les compétences pour le travail d'équipe et communication en anglais sont souhaitables.
Niveau de qualification requis
Bac + 4/5 et +
Les offres de stage ou de contrat sont définies par les recruteurs eux-mêmes.
En sa qualité d’hébergeur dans le cadre du dispositif des « 100 000 stages », la Région Île-de-France est soumise à un régime de responsabilité atténuée prévu aux articles 6.I.2 et suivants de la loi n°2204-575 du 21 juin 2004 sur la confiance dans l’économie numérique.
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EmployeurCNRS DR04 ILE DE FRANCE SUD - I2BC
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Secteur d’activité de la structureEnseignement - Formation - Recherche
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Effectif de la structurePlus de 250 salariés
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Site internet de la structurehttps://www.i2bc.paris-saclay.fr
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Type de stage ou contratStage pour lycéens et étudiants en formation initiale
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Date prévisionnelle de démarrage
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Durée du stage ou contratPlus de 4 mois et jusqu'à 6 mois
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Le stage est-il rémunéré ?Oui
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Niveau de qualification requis
Bac + 4/5 et + -
Lieu du stageCNRS I2BC UMR 9198 Bâtiment 400
Université Paris Sud
91400 ORSAY -
Accès et transportsRER B