STAGE Le rôle des ARN régulateurs chez un pathogène humain Clostridium difficile

Clostridium difficile est un bacille à Gram positif, anaérobie strict et capable de sporuler. Ce pathogène opportuniste est la principale cause de diarrhées nosocomiales chez les adultes dans les pays industrialisés. Les facteurs de risque sont l’âge et l’antibiothérapie qui par son action sur la flore intestinale facilite l’émergence de C. difficile dans le tube digestif. La proportion de formes sévères d’infections à C. difficile augmente actuellement de manière très préoccupante en Europe. Le pouvoir pathogène de C. difficile résulte de l'action des deux toxines (TcdA et TcdB) qui altèrent le cytosquelette des entérocytes en glucosylant des GTPases régulant le cycle cellulaire. Plusieurs facteurs impliqués dans l’adhésion de C. difficile aux entérocytes ont été identifiés. Cependant, les processus de colonisation du tube digestif et les fonctions associées ainsi que les mécanismes qui contrôlent la virulence sont encore peu étudiés. Des adaptations métaboliques, la motilité, l’efficacité d’adhésion, la capacité de former des biofilms, de sporuler, de germer ou de résister aux stress figurent parmi les processus pouvant jouer un rôle lors du processus infectieux. Mieux comprendre la régulation de ces processus semble indispensable pour l’étude de ce pathogène émergent humain.
Au cours de l’infection, les bactéries reprogramment l'expression de leurs gènes en réponse aux contraintes environnementales. Des études récentes du transcriptome bactérien ont montré la présence d’un grand nombre d’ARN non codants (ARNnc). Ces ARN régulateurs jouent un rôle clé dans la régulation des réponses adaptatives et dans de nombreux processus métaboliques, physiologiques et pathogéniques. Les Clostridies appartiennent à un groupe bactérien ancien qui semble utiliser des mécanismes de régulation complexes basés sur l’action d’ARNnc pour contrôler finement l’expression de leurs gènes, leur permettant ainsi de s’adapter à leurs hôtes et aux conditions environnementales qu’elles rencontrent. Des exemples de tels systèmes de régulation ont été identifiés chez C. perfringens et C. acetobutylicum.