STAGE Imagerie 3-dimensionelle par microscopie à feuille de lumière

Date de mise à jour de l’offre

établissement publiquee :

L’Institut de biologie Paris-Seine (IBPS - FR3631), créé le 1er janvier 2014, concentre l’ensemble de la recherche en biologie du campus Pierre et Marie Curie, au sein de Sorbonne Université (SU), où cette discipline a occupé de tout temps une place centrale. Situé dans le bâtiment du Quai St-Bernard au bord de la Seine, l’IBPS regroupe plus de 500 personnes réparties dans 5 unités et 7 plateformes technologiques. Le stage aura lieu au sein de la plate-forme d’imagerie Cellulaire (responsable S. Bolte, http://www.ibps.upmc.fr/fr/plateformes) et en étroite collaboration avec l’équipe de Thierry Jaffredo (http://www.ibps.upmc.fr).

Description de la mission

Le stagiaire effectuera une visualisation 3-dimensionnelle de l’échantillon de poulet après clarification d’embryons marqués avec un marqueur fluorescent pour le système vasculaire. Il procédera dans un premier temps à clarifier l’échantillon avec des méthodes (iDISCO, iDISCO+, simple immersion) établis au laboratoire. Des mesures de taille et de déformation seront effectuées avec l’aide d’un macroscope et un logiciel d’analyse d’images (ImageJ). Ensuite, l’acquisition des échantillons avec un microscope à feuille de lumière (Phaseview) en 3 dimensions suivi par la visualisation 3D avec un logiciel dédié sera faite, afin d’évaluer la qualité d’échantillon dans les différents milieux de clarification.

Le stagiaire bénéficiera d’une formation dans des méthodes de microscopie de fluorescence et d’analyse et de visualisation d’images par le personnel de la plate-forme. Pour la partie biologique, il sera encadré par l’équipe de recherche.

Le stagiaire aura accès à :
-macroscope
-microscope à feuille de lumière
-station d’analyse et visualisation des données

Profil recherché

Idéalement, le stagiaire suit un cursus de biologie ou de biotechnologie ou disciplines voisins. Le stage est d’un niveau M1.

Niveau de qualification requis

Bac + 3
  • Employeur
    établissement publiquee
  • Secteur d’activité de la structure
    Enseignement - Formation - Recherche
  • Effectif de la structure
    Plus de 250 salariés
  • Site internet de la structure
    http://www.ibps.upmc.fr
  • Type de stage ou contrat
    Stage pour lycéens et étudiants en formation initiale
  • Date prévisionnelle de démarrage
  • Durée du stage ou contrat
    2 mois
  • Le stage est-il rémunéré ?
    Oui
  • Niveau de qualification requis

    Bac + 3
  • Lieu du stage
    Bâtiment B, 7eme étage
    4 Place Jussieu
    75005 PARIS 5E ARRONDISSEMENT
  • Accès et transports
    metro Jussieu