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STAGE Développement d’une base de connaissances intégrant associations entre événements moléculaires tumoraux (modifications génétiques, dérégulation de la transcription des gènes) et sensibilités à des tra
Date de mise à jour de l’offre
Ariana Pharmaceuticals :
Ariana Pharmaceuticals SA (Ariana), PME francilienne basée à Paris, est une société du secteur de la bioinformatique spécialisée dans le développement et la commercialisation de technologies innovantes pour l’analyse de données complexes en sciences de la vie.
Grâce à l’application de sa technologie propriétaire KEM (Knowledge Extraction and Management) et de ses solutions analytiques innovantes, Ariana permet aujourd’hui à ses partenaires et clients du secteur de la santé d’identifier les meilleures stratégies thérapeutiques pour chaque patient à travers l’amélioration de la stratification des populations de patients et l’optimisation de signatures de biomarqueurs (diagnostiques ou pronostiques). Ariana développe actuellement un pipeline de logiciels d’aide à la décision et à la sélection de traitement en oncologie (Onco KEM) et différents algorithmes prédictifs embarqués dans des outils de diagnostic ou de médecine personnalisée.
Description de la mission
Le stage s’intégrera dans le cadre du programme de recherche Winther qui vise à répondre au besoin non encore satisfait de sélection individualisée et rationnelle des thérapies anticancéreuses en développant une nouvelle méthode innovante capable de prédire l’efficacité potentielle des traitements à un niveau individuel. L’algorithme prédictif, développé par l’institut IGR, qui permet de générer un classement des thérapies disponibles sur la base des données moléculaires de la tumeur d’un patient est actuellement en validation clinique (essai clinique NCT01856296). Une partie de l’algorithme utilise les données d’expression ARN des tissus tumoraux et des tissus sains d’un même patient et nécessite une interprétation par une base de connaissance associant événements moléculaires tumoraux et sensibilités à des traitements. La base de connaissance actuelle contient 178 traitements actuellement disponibles sur le marché ou bien en développement clinique. L’objectif est d’augmenter la taille de la base de connaissance pour se rapprocher des 300 médicaments actuellement disponibles et des 500 en stade avancé de développement. Les outils qui seront utilisées sont les plateformes de programmation R et KNIME.
Profil recherché
Vous avez :
– Une formation supérieure (Master, Bac+5) ou équivalent en (bio)statistique/data mining.
_ Vous avez des connaissances en statistiques descriptives, inférentielles (tests d’hypothèses), la modélisation (modèle linéraire, mixte …), le machine learning (SVM, Random Forest…) et vous avez une bonne connaissance des méthodes statistiques en général.
–– Un bon niveau en programmation en R. Autres langages/environnements de programmation seraient un plus.
–– Un bon niveau d’anglais à l’oral et à l’écrit est indispensable.
– Une formation supérieure (Master, Bac+5) ou équivalent en (bio)statistique/data mining.
_ Vous avez des connaissances en statistiques descriptives, inférentielles (tests d’hypothèses), la modélisation (modèle linéraire, mixte …), le machine learning (SVM, Random Forest…) et vous avez une bonne connaissance des méthodes statistiques en général.
–– Un bon niveau en programmation en R. Autres langages/environnements de programmation seraient un plus.
–– Un bon niveau d’anglais à l’oral et à l’écrit est indispensable.
Niveau de qualification requis
Bac + 4/5 et +
Les offres de stage ou de contrat sont définies par les recruteurs eux-mêmes.
En sa qualité d’hébergeur dans le cadre du dispositif des « 100 000 stages », la Région Île-de-France est soumise à un régime de responsabilité atténuée prévu aux articles 6.I.2 et suivants de la loi n°2204-575 du 21 juin 2004 sur la confiance dans l’économie numérique.
La Région Île-de-France ne saurait être tenue responsable du contenu des offres.
Néanmoins, si vous détectez une offre frauduleuse, abusive ou discriminatoire vous pouvez la signaler
en cliquant sur ce lien.
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EmployeurAriana Pharmaceuticals
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Secteur d’activité de la structureEnseignement - Formation - Recherche
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Effectif de la structureDe 11 à 20 salariés
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Type de stage ou contratStage pour lycéens et étudiants en formation initiale
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Date prévisionnelle de démarrage
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Durée du stage ou contratPlus de 4 mois et jusqu'à 6 mois
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Le stage est-il rémunéré ?Oui
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Niveau de qualification requis
Bac + 4/5 et + -
Lieu du stage28 rue du Dr Finlay
75015 Paris -
Accès et transportsMétro Ligne 6 Dupleix /RER C Tour Eiffel/Velib