STAGE BIOLOGIE COMPUTATIONNELLE

Date de mise à jour de l’offre

IMAGINE INSTITUT DES MALADIES GENETIQUES NECKER ENFANTS MALADES :

Créé à l’initiative des chercheurs et médecins de l’Hôpital Necker Enfants malades, l’Institut hospitalo universitaire (IHU) sur les maladies génétiques d’Imagine développe des programmes scientifiques fondés sur une continuité entre recherche fondamentale, recherche clinique et soins innovants sur les maladies génétiques et les prédispositions génétiques aux maladies fréquentes, de l’enfance à l’âge adulte. Imagine a pour ambition d’accélérer la recherche en l’organisant au plus près des malades afin d’apporter des solutions diagnostiques et thérapeutiques attendues par les patients et leurs familles.

Description de la mission

L'objectif de ce stage sera d'utiliser des données Single Cell RNA Seq temporelles et autre données omics pour identifier l'évolution de biomarqueurs au cours de l'évolution d'une pathologie ou d'un traitement médical. Vous prototyperez un workflow qui devra inclure les étapes de nettoyage de données, de normalisation et d'analyse différentielle et temporelle. Vous appliquerez ensuite ce workflow aux données obtenues dans le cadre de différents projets afin d'identifier les biomarqueurs caractéristiques des étapes clés du développement d'une pathologie ou d'un retour à l'état physiologique.

Profil recherché

Le candidat devra avoir: une formation en informatique ou en bioinformatique, des connaissances en intelligence artificielle, en informatique à haut débit et de très bonnes compétences en programmation; quelques connaissances en biologie (transcriptomique, bioinformatique structurale) sont un plus. Les compétences en travail d'équipe sont essentielles à la réalisation du projet.

Niveau de qualification requis

Bac + 4/5 et +
  • Employeur
    IMAGINE INSTITUT DES MALADIES GENETIQUES NECKER ENFANTS MALADES
  • Secteur d’activité de la structure
    Enseignement - Formation - Recherche
  • Effectif de la structure
    De 51 à 250 salariés
  • Site internet de la structure
    http://www.institutimagine.org
  • Type de stage ou contrat
    Stage pour lycéens et étudiants en formation initiale
  • Date prévisionnelle de démarrage
  • Durée du stage ou contrat
    Plus de 4 mois et jusqu'à 6 mois
  • Le stage est-il rémunéré ?
    Oui
  • Niveau de qualification requis

    Bac + 4/5 et +
  • Lieu du stage
    24 Boulevard du Montparnasse
    75015 PARIS 15E ARRONDISSEMENT
  • Accès et transports
    Métro Duroc